Docteur de l'INSA de Lyon (2009), je suis actuellement post-doctorant au sein du laboratoire CREATIS (CNRS, INSERM) à Lyon. Mes recherches portent sur la modélisation volumique à partir de données médicales (IRM ou tomographie X) et la simulation numérique de phénomènes électromagnétique et thermique. Cette modélisation permet de déterminer la répartition du champ électrique induit et l'élévation de température dans le corps lors de son exposition à des champs radio-fréquences ou micro-ondes. En plus de mon travail de recherche, je dispense des enseignements à l'université Lyon 1 en électronique, informatique et mathématique.

Issue d'une formation basée sur la pluridisciplinarité, mon objectif est de m'intégrer dans le domaine de la R&D dans le secteur de l'imagerie médicale

Septembre 2006 - Septembre 2009

Thèse de doctorat aux laboratoires CREATIS-LRMN (CNRS, INSERM) et Ampère (CNRS)

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Sujet : Maillage 3D de structures anatomiques pour la simulation électromagnétique et thermique.

Dans son environnement quotidien, l'homme est volontairement ou involontairement exposé à des champs électromagnétiques radiofréquences. La prédiction de l'élévation de température induite par ce rayonnement, à l'aide d'un calcul sur un modèle anatomique maillé, dépend beaucoup de la qualité de ce modèle. Les méthodes actuelles de génération de maillages volumiques utilisent des représentations surfaciques intermédiaires des données anatomiques. Nous montrons qu'il n'est pas nécessaire d'avoir une représentation surfacique pour générer un maillage volumique. Nous proposons une construction de maillages tétraédriques basée sur les diagrammes de Voronoi Centroïdaux et leur dual, la triangulation de Delaunay. Cette approche, contrairement aux approches de la littérature, traite directement un volume de voxels segmentés, obtenu par IRM ou par tomographie X, sans passer par une représentation surfacique. Afin d'obtenir des maillages, non plus uniformes mais adaptés à la complexité anatomique, nous avons proposé une nouvelle méthode de capture de cette complexité à l'aide d'une approximation de l'axe médian. Une comparaison, avec trois autres méthodes de génération de maillages de la littérature, montre que notre approche construit des tétraèdres de meilleure qualité géométrique pour différents critères. De cette qualité découle une meilleure précision sur la température induite par le rayonnement électromagnétique, calculée par une méthode d'éléments finis, ainsi qu'un temps de calcul réduit. Ces résultats montrent le potentiel de notre approche discrète de type "Voronoï-Delaunay" pour la génération de maillages tétraédriques.

Cette recherche interdisciplinaire s'inscrit dans le cadre d'une collaboration entre les laboratoires CREATIS-LRMN et AMPERE.

Directeurs de thèse : Rémy Prost et Noel Burais.
Co-Encadrants : Sébastien Valette et Nicolas Siauve.

Eté 2007, Centre Internationale de Rencontres Mathématiques, Marseille

Centre d'été Mathématique de Recherche Avancée en Calcul Scientifique

Aspects de pré et post traitement en calcul scientifique :
- Génération et l'adaptation de maillage,
- Estimations d'erreur,
- Visualisation scientifique.

2006, Université de Rouen, UFR des Sciences

Master Recherche IGIS, spécialité Reconnaissance de Forme.(mention AB)

-> Fiche formation

Master Professionnel IGIS, specialité Systèmes d'Acquisition et de Traitement de l'Information.(mention B)

-> Fiche formation

2005, Université de Rouen, UFR des Science

Maitrise E.E.A (mention AB)

option : Traitement de l'information.

2004, Université de Rouen, UFR des Sciences

License E.E.A

option : Electronique.

2003, IUT de Rouen

D.U.T G.E.I.I (Génie Electrique et Informatique Industrielle)

option : Electronique.

2001, Lycée Clément-Ader, Bernay.

Baccalauréat Technologique, spécialité Génie Electronique.(mention AB)

Option : Electronique.

Depuis Septembre 2009

Enseignant/Chercheur à l'IUT-B de Villeurbanne et au laboratoire CREATIS

Description : Je suis actuellement chercheur post-doctorant autour des thématiques du traitement d'images biomédicales. Je m'intéresse particulièrement à la modélisation multi-échelle et adaptative dans le cadre de simulation numérique par la méthode des éléments finis.

langage : C/C++, librairies : ITK, VTK, GDCM, QT, Géométrie algorithmique et discrète, Simulation numérique en électromagnétique et en thermique (MEF), Modélisation et Visualisation, Segmentation et Imagerie Médicale

Octobre 2006 - Septembre 2009

Allocataire de recherche aux laboratoire CREATIS et AMPERE (Thèse en co-encadrement).

Projet : Développement d'une stratégie de maillage de l'anatomie du corps humain pour la résolution d'EDP. Mes travaux portent sur le développement d'une stratégie de représentations maillées du corps humain ayant de bonne propriété pour la résolution d'équations aux dérivées partielles.

Mars - Septembre 2006

Stage de Master Recherche et Professionnel

Stage au laboratoire LITIS sur l’application d’une méthode de segmentation d’image de document par champs aléatoires conditionnels pour l’analyse de documents de la Renaissance.
Mots clés : Descripteur, champ de Markov, CRF, CRF 2D, méthode d’optimisation, inférence, projet MADONNE.
Site : -> Laboratoire LITIS.

Janvier - Février 2006

TER de 50 heures

Projet de Recherche sur un système de séparation avant-plan / arrière-plan de document manuscrit.
Mots clés : DjVu, Filtre de Gabor, Champ de Markov.
Site : -> Laboratoire LITIS.

Janvier - Avril 2005

TER de 100 heures

Projet de Recherche sur un système de détection automatisé de faux documents par analyse de la texture.
Mots clés : DjVu, Filtre de Gabor, Matrices de cooccurences et Paramètres d’Haralick.
Site : -> Laboratoire LITIS.

Génie Informatique

Systèmes: Windows et Linux.
Conception: UML et Merise.
Librairies : ITK, VTK, Gdcm (DICOM), QT
Programmation: C/C++, Python, Java, Matlab et Assembleur.
Outils : GNU (gcc, gdb, make, etc.), (D)VCS (git, cvs, subversion)
Web: Html, Xml, Javascript et Php.
Bases de données: MySql, Access.
Bureautique: Office, OpenOffice, LATEX.

Génie Electrique et Traitement de l'Information

- Géométrie Discrète et Maillage.
- Traitement du signal analogique et numérique.
- Système d'acquisition et traitement de l'information.
- Electronique, Electrotechnique et Automatisme.
- Traitement d'image, Analyse de données, Reconnaissance de Forme.

Langues

Anglais : Bon niveau.
Allemand : niveau scolaire.

Conférences nationales avec comité de lecture et actes

[1] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve and R. Prost, Génération de maillages triangulaires adaptatifs 2d avec des diagrammes de voronoï centroïdaux, colloque Gretsi, 2009, Dijon, France.

[2] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve and R. Prost, Approximation de l'axe médian pour les objets discrets avec prise en compte de la courbure, colloque Gretsi, 2009, Dijon, France.

[3] Julien Dardenne, "Génération de maillages tétraédriques adaptatifs de structure anatomique du corps humain pour la simulation électromagnétique et thermique", 8e conférence des Jeunes Chercheurs en Génie Electrique, JCGE'2008, Décembre 2008, Lyon, France. Premier Prix JCGE'08

[4] Stéphane Nicolas, Julien Dardenne, Thierry Paquet and Laurent Heutte, "Un modèle de champ aléatoire conditionnel 2D appliqué à la segmentation d'images de documents", 6e congrès francophone AFRIF-AFIA, Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle, RFIA'2008, 22-25 janvier 2008, Amiens, France. Prix du meilleur papier en Reconnaissance de Formes.

Conférences internationales avec comité de lecture et actes

[1] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve, R. Prost and N. Burais, Impact of Tetrahedral Mesh Quality for Electromagnetic and Thermal Simulations. In Proceedings of the IEEE International Conference on the Computation of Electromagnetic, COMPUMAG'09, Florianopolis, Brazil, November 2009.

[2] N. Siauve, C. Lormel, R. Marion, J. Dardenne and F. Sixdenier. Electromagnetic Characterization of Biological Tissues with Particle Swarm Optimization. In Proceedings of the IEEE International Conference on the Computation of Electromagnetic, COMPUMAG'09, Florianopolis, Brazil, November 2009.

[3] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve, B. Khaddour and R. Prost, Exploiting Curvature to compute the Medial Axis with Constrained Centroidal Voronoi Diagram On Discrete Data, In IEEE International Conference on Image Processing , ICIP'09, Cairo, Egypt, pages in-press, November 2009.

[4] Julien Dardenne, Sébastien Valette, Nicolas Siauve, Noël Burais and Rémy Prost, Variational tetrahedral mesh generation from discrete volume data, CGI 2009, Victoria, Canada.

[5] Julien Dardenne, Sébastien Valette, Nicolas Siauve and Rémy Prost, Medial Axis Approximation with Constrained Centroidal Voronoi Diagrams On Discrete Data , CGI 2008, Istanbul, Turkey.

[6] S. Nicolas, J. Dardenne, T. Paquet, L. Heutte, Document Image Segmentation Using a 2D Conditionnal Random Field Model , ICDAR 2007, Curitiba, Brazil.

Revues internationales

[1] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve and R. Prost, Modélisation adaptative 3D de structures anatomiques pour la simulation électromagnétique et thermique. European Journal of Electrical Engineering, pp in press, 2009.

[2] J. Dardenne, S. Valette, N. Siauve and R. Prost,Variational tetraedral mesh generation from discrete volume data, The Visual Computer (proceedings of CGI 2009), Volume 25, no. 5, pages 401-410, May 2009.

[3] S. Nicolas, J. Dardenne, T. Paquet and L. Heutte, Utilisation de modèles markoviens 2D pour la segmentation d'images de documents, revue I3, 2009.

2009-2010

ATER à l'IUT B de l'université Claude Bernard Lyon 1 (GEII)

TD de maths
TP d'informatique

2008/2009

Vacataire à l'Ecole Supérieure Chimie Physique Electronique de Lyon

- Tp d'Electrotechnique (36h eq td).
Programme :
- Transformateur triphasé,
- Moteur Synchrone,
- Moteur Asynchrone,
- Machine à Courant Continu.

2008/2009

Vacataire à l'Université Lyon 1

- Préparation au C2I (36h eq td).

2007/2008

Vacataire à l'Ecole Supérieure Chimie Physique Electronique de Lyon

- Tp d'Electrotechnique (20h eq td).
Programme :
- Transformateur triphasé,
- Moteur Synchrone,
- Moteur Asynchrone,
- Machine à Courant Continu.

2007/2008

Vacataire à l'IUT B (Villeurbanne), Département GMP

- Tp d'Electronique (24h eq td).

- Tp d'Electrotechnique (18h eq td).

2006/2007

Vacataire à l'INSA de Lyon, Département Génie Energetique

- Tp de Commande par calculateur (48h eq td): acquisition, régulation, correcteurs et commande RST.

- Td de Commande par calculateur (14h eq td).

Musique

Pratique de la guitare.

Lecture

Romans, Essais, Sciences-Fictions et Polars.

Sport

Vélo et marche à pied.